15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2111 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  100 
 
 		 135 aa  277  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4249  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  80.15 
 
 		 134 aa  221  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1880  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  65.62 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.734657  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1926  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  65.62 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0236938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  65.62 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121718  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2905  hypothetical protein  54.2 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0621154  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0948  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.2 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.57219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3252  hypothetical protein  54.96 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.44 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0031  hypothetical protein  30.33 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4210  hypothetical protein  44.64 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109507  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5080  hypothetical protein  34.21 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0837  hypothetical protein  29.82 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>