99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0498 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  247  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1369  hypothetical protein  53.85 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1268  hypothetical protein  47.52 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000457076 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  44.25 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  52.5 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  46.55 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1730  hypothetical protein  34.39 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  42.24 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  42.61 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  46.9 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  42.98 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  42.73 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  42.24 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  42.73 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  44.04 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  43.75 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  37.07 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  44.54 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  37.61 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0598  hypothetical protein  40.18 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0473  hypothetical protein  40.18 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00529  hypothetical protein  40.18 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00540  hypothetical protein  40.18 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3067  hypothetical protein  40.18 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0626  hypothetical protein  40.18 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0660  hypothetical protein  40.18 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3050  protein of unknown function DUF419  40.18 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0597  hypothetical protein  40.18 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  38.33 
 
 		 124 aa  90.5  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  36.8 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  36 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  39.13 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0489  hypothetical protein  56.25 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131029  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20250  hypothetical protein  40.38 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  43.01 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2559  hypothetical protein  38.39 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0215173  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0632  hypothetical protein  39.62 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  38.84 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0618  hypothetical protein  39.62 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0691  hypothetical protein  39.62 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0675  hypothetical protein  39.62 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0185336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2605  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.516172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2831  hypothetical protein  36.61 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00686416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  35.71 
 
 		 117 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2528  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0443587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2851  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00191961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12530  hypothetical protein  41.18 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1075  hypothetical protein  40.62 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  38.26 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0096  protein of unknown function DUF419  32.74 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.503641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  37.37 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  35.11 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  30.43 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  30.43 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  30.43 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1743  hypothetical protein  36.04 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  26.05 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  26.05 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  26.05 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  26.05 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  26.05 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  26.05 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  26.05 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  26.05 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  26.05 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  33.62 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4646  hypothetical protein  26.61 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4594  hypothetical protein  27.1 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4595  hypothetical protein  27.1 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4500  protein YjbR  27.1 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4508  protein YjbR  27.1 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4443  hypothetical protein  29.41 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0505  hypothetical protein  60.47 
 
 		 53 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.625652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12540  hypothetical protein  26.04 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2779  protein of unknown function DUF419  26.5 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273215  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0269  30S ribosomal protein S8  36.21 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1085  hypothetical protein  31.19 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.521139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0260  hypothetical protein  24.79 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3350  protein of unknown function DUF419  33.93 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2484  hypothetical protein  29.2 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2801  hypothetical protein  38.03 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.950543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2611  hypothetical protein  38.03 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2809  hypothetical protein  38.03 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000596954 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0377  hypothetical protein  31.87 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5080  hypothetical protein  29.13 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6087  protein of unknown function DUF419  31.58 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.987598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2592  hypothetical protein  34.21 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.550505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  26.27 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  25.22 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0449  hypothetical protein  27.78 
 
 		 354 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000397187  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0681  hypothetical protein  42.59 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1379  hypothetical protein  25.22 
 
 		 112 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640185  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  26.61 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  26.96 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  26.36 
 
 		 122 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 117 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  27.19 
 
 		 116 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>