68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3016 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  244  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6087  protein of unknown function DUF419  47.01 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.987598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2592  hypothetical protein  44.44 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.550505 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1720  YyaQ  43.97 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0269  30S ribosomal protein S8  40.17 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3350  protein of unknown function DUF419  43.24 
 
 		 222 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2118  protein of unknown function DUF419  41.38 
 
 		 114 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0880  protein of unknown function DUF419  35.4 
 
 		 234 aa  88.2  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0449  hypothetical protein  36.28 
 
 		 354 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000397187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  33.62 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2484  hypothetical protein  33.06 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  34.19 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  47.37 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  33.9 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  27.97 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  44.64 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  44.64 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  44.64 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1730  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1369  hypothetical protein  41.07 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  33.72 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2605  hypothetical protein  35.29 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.516172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  33.64 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1268  hypothetical protein  41.07 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000457076 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  40.74 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  40.74 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  40.74 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  40.74 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  40 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  36.51 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  42.11 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  40.74 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  40.74 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2528  hypothetical protein  34.88 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0443587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  40.74 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  40.74 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  31.62 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12530  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  39.66 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4443  hypothetical protein  40.35 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4595  hypothetical protein  36.05 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4594  hypothetical protein  36.05 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0260  hypothetical protein  40.38 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2851  hypothetical protein  35.29 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00191961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  36.84 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2559  hypothetical protein  34.88 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0215173  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4646  hypothetical protein  39.62 
 
 		 118 aa  43.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2831  hypothetical protein  34.88 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00686416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  48.65 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4508  protein YjbR  39.62 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4500  protein YjbR  39.62 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  36.36 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  32.94 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  32.94 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  32.93 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  34.62 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  28.57 
 
 		 120 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  39.29 
 
 		 135 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  25 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0675  hypothetical protein  39.66 
 
 		 122 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0185336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0618  hypothetical protein  39.66 
 
 		 122 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0691  hypothetical protein  39.66 
 
 		 122 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0632  hypothetical protein  39.66 
 
 		 122 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  30.99 
 
 		 119 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>