15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2118 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2118  protein of unknown function DUF419  100 
 
 
114 aa  243  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  41.38 
 
 
117 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2592  hypothetical protein  40.18 
 
 
118 aa  90.5  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.550505 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1720  YyaQ  33.91 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6087  protein of unknown function DUF419  37.5 
 
 
118 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.987598  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0269  30S ribosomal protein S8  35.78 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3350  protein of unknown function DUF419  29.91 
 
 
222 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0449  hypothetical protein  30.36 
 
 
354 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000397187  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0880  protein of unknown function DUF419  32.18 
 
 
234 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20250  hypothetical protein  40.32 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  31.03 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  32.67 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  36.36 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  38.6 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  30.68 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>