62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6087 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6087  protein of unknown function DUF419  100 
 
 
118 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.987598  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2592  hypothetical protein  67.8 
 
 
118 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.550505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  47.01 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1720  YyaQ  43.97 
 
 
116 aa  114  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0269  30S ribosomal protein S8  35.9 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3350  protein of unknown function DUF419  35.71 
 
 
222 aa  90.1  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2118  protein of unknown function DUF419  37.5 
 
 
114 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0880  protein of unknown function DUF419  32.43 
 
 
234 aa  77  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  37.07 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0449  hypothetical protein  32.43 
 
 
354 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000397187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  41.46 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  33.93 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  41.82 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  38.6 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2484  hypothetical protein  29.75 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  31.53 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  32 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  30.36 
 
 
124 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  51.43 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  40.68 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  45.95 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  32.89 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1730  hypothetical protein  38.18 
 
 
168 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  31.58 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1369  hypothetical protein  37.5 
 
 
128 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  35.71 
 
 
123 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  36.84 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1268  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000457076 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  38.89 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  38.89 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  38.89 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  38.89 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0260  hypothetical protein  40.38 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  38.89 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  38.89 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  38.89 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  38.89 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  38.89 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  39.29 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  29.91 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  35.06 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2851  hypothetical protein  38.71 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00191961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2831  hypothetical protein  38.1 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00686416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2559  hypothetical protein  38.71 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0215173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2528  hypothetical protein  38.71 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0443587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  35.48 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  35.48 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4646  hypothetical protein  38.46 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4508  protein YjbR  38.46 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4500  protein YjbR  38.46 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  32.81 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  36.84 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4594  hypothetical protein  38.46 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4595  hypothetical protein  38.46 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  35.71 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  38.6 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  35.71 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2605  hypothetical protein  37.1 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.516172  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  35.71 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  33.77 
 
 
119 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0681  hypothetical protein  42.11 
 
 
179 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  41.2  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>