15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1720 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1720  YyaQ  100 
 
 		 116 aa  238  2.9999999999999997e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2592  hypothetical protein  45.69 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.550505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  43.97 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0269  30S ribosomal protein S8  44.83 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6087  protein of unknown function DUF419  43.97 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.987598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2118  protein of unknown function DUF419  33.91 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0880  protein of unknown function DUF419  37.63 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3350  protein of unknown function DUF419  35.14 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0449  hypothetical protein  34.95 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000397187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  35.94 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  36.21 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  35.09 
 
 		 135 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  33.9 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  41.38 
 
 		 163 aa  40.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  31.58 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>