37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2592 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2592  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  244  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.550505 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6087  protein of unknown function DUF419  67.8 
 
 		 118 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.987598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  44.44 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1720  YyaQ  45.69 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0269  30S ribosomal protein S8  35.9 
 
 		 117 aa  96.7  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3350  protein of unknown function DUF419  37.5 
 
 		 222 aa  92.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2118  protein of unknown function DUF419  40.18 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0880  protein of unknown function DUF419  30.63 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0449  hypothetical protein  34.19 
 
 		 354 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000397187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  34.17 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  47.37 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  32.14 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  33.7 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2484  hypothetical protein  33.02 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  43.64 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  40.35 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1369  hypothetical protein  36.11 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  39.39 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  40.35 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1268  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000457076 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  35.71 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  34.21 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1730  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  29.06 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  32.81 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  32.84 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  33.87 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  29.52 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  32.81 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2605  hypothetical protein  34.38 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.516172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  45.71 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  32.41 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  30 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  32.43 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  33.93 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  36.36 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>