47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3350 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3350  protein of unknown function DUF419  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0880  protein of unknown function DUF419  38.43 
 
 
234 aa  169  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0449  hypothetical protein  31.05 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000397187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  43.24 
 
 
117 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2592  hypothetical protein  37.5 
 
 
118 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.550505 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6087  protein of unknown function DUF419  35.71 
 
 
118 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.987598  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0269  30S ribosomal protein S8  34.82 
 
 
117 aa  89.4  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1720  YyaQ  35.14 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2118  protein of unknown function DUF419  29.91 
 
 
114 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  61.76 
 
 
119 aa  51.6  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  33.93 
 
 
120 aa  51.6  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1730  hypothetical protein  42.86 
 
 
168 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  36.92 
 
 
122 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  44.44 
 
 
141 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  42.11 
 
 
163 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1369  hypothetical protein  37.27 
 
 
128 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  60 
 
 
116 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1268  hypothetical protein  45.45 
 
 
156 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000457076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  43.64 
 
 
116 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  31.18 
 
 
114 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  33.33 
 
 
117 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  50 
 
 
117 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  38.6 
 
 
118 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  38.6 
 
 
118 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  38.6 
 
 
118 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  38.6 
 
 
118 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0260  hypothetical protein  51.43 
 
 
117 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  38.6 
 
 
118 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  38.6 
 
 
118 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  38.6 
 
 
118 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  38.6 
 
 
118 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2605  hypothetical protein  34.57 
 
 
117 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.516172  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  38.6 
 
 
118 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  43.1 
 
 
116 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  43.4 
 
 
111 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4500  protein YjbR  45.71 
 
 
118 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4646  hypothetical protein  45.71 
 
 
118 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4508  protein YjbR  45.71 
 
 
118 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4595  hypothetical protein  45.71 
 
 
118 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  45.71 
 
 
123 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4594  hypothetical protein  45.71 
 
 
118 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  34.43 
 
 
124 aa  42.4  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2851  hypothetical protein  39.68 
 
 
117 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00191961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  36.84 
 
 
117 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2559  hypothetical protein  39.68 
 
 
117 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0215173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2528  hypothetical protein  39.68 
 
 
117 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0443587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>