104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1307 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  100 
 
 
111 aa  231  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  58.04 
 
 
116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  60.71 
 
 
117 aa  143  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  57.39 
 
 
123 aa  138  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  58.04 
 
 
119 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  56.88 
 
 
116 aa  130  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  52.25 
 
 
117 aa  123  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0096  protein of unknown function DUF419  52.25 
 
 
114 aa  120  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.503641  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  50.88 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  49.53 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  50.89 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2528  hypothetical protein  46.3 
 
 
117 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0443587  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  46.43 
 
 
126 aa  104  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2559  hypothetical protein  46.3 
 
 
117 aa  103  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0215173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  46.3 
 
 
117 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  46.3 
 
 
117 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  46.9 
 
 
120 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2831  hypothetical protein  45.37 
 
 
117 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00686416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2851  hypothetical protein  44.44 
 
 
117 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00191961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2605  hypothetical protein  44.44 
 
 
117 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.516172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1369  hypothetical protein  39.67 
 
 
128 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  44.17 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  47.47 
 
 
116 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  43.12 
 
 
129 aa  97.1  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  40.83 
 
 
136 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  40.98 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1268  hypothetical protein  36.84 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000457076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  42.73 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  42.73 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  42.73 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1730  hypothetical protein  34.93 
 
 
168 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12530  hypothetical protein  46.6 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  41.44 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  47.12 
 
 
141 aa  87  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1743  hypothetical protein  44.64 
 
 
115 aa  87.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0632  hypothetical protein  40.57 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0691  hypothetical protein  40.57 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0618  hypothetical protein  40.57 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0675  hypothetical protein  40.57 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0185336  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4443  hypothetical protein  39.29 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  41.28 
 
 
117 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  37.25 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0598  hypothetical protein  40.37 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1075  hypothetical protein  39.81 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0597  hypothetical protein  39.45 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0473  hypothetical protein  39.45 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00540  hypothetical protein  39.45 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3050  protein of unknown function DUF419  39.45 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0626  hypothetical protein  39.45 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3067  hypothetical protein  39.45 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62125  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0660  hypothetical protein  39.45 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00529  hypothetical protein  39.45 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  34.86 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  44.79 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  35.14 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  35.14 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  35.14 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  35.14 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  35.14 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  35.14 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  35.14 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  35.14 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4500  protein YjbR  33.03 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4508  protein YjbR  33.03 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0260  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  35.14 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4595  hypothetical protein  32.11 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4594  hypothetical protein  32.11 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  43.88 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4646  hypothetical protein  32.71 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20250  hypothetical protein  38.46 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  36.7 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  37.84 
 
 
156 aa  66.6  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0489  hypothetical protein  41.25 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2611  hypothetical protein  43.66 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207111  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2801  hypothetical protein  43.66 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.950543  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0377  hypothetical protein  40.91 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2809  hypothetical protein  43.66 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000596954 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2484  hypothetical protein  36.04 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  32.65 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12540  hypothetical protein  32.29 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1085  hypothetical protein  37.17 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.521139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  31.07 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2779  protein of unknown function DUF419  27.83 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  28.83 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  29.73 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  32.17 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2807  hypothetical protein  50 
 
 
45 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2609  hypothetical protein  47.5 
 
 
45 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.213586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2799  hypothetical protein  47.5 
 
 
45 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6087  protein of unknown function DUF419  32.89 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.987598  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  27.93 
 
 
122 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  29.2 
 
 
134 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  26.36 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0269  30S ribosomal protein S8  37.04 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  36.51 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  27.68 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  25.45 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  29.73 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  29.31 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>