70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12540 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12540  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  37.82 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  36.44 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  39.66 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0691  hypothetical protein  36.21 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0618  hypothetical protein  36.21 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0675  hypothetical protein  36.21 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0185336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0632  hypothetical protein  36.21 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  37.63 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0598  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3067  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0473  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0660  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3050  protein of unknown function DUF419  32.76 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00529  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00540  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0626  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0597  hypothetical protein  32.76 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  32.69 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1075  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1743  hypothetical protein  40.21 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  31.43 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12530  hypothetical protein  31.25 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20250  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  33.03 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  29.7 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  36.94 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  33.9 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  33.03 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  35.64 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  32.29 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  27.19 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  30.33 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0096  protein of unknown function DUF419  30.1 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.503641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  32.04 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  30.53 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  26.04 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  28.18 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  29.29 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  26.85 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  33.72 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  33.72 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  33.72 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  33.72 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  33.72 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  33.72 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  33.72 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  33.72 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  33.72 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  32.29 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  22.32 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4508  protein YjbR  31.82 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4500  protein YjbR  31.82 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4594  hypothetical protein  31.82 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4595  hypothetical protein  31.82 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0260  hypothetical protein  29.07 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  28.72 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  26.8 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  28.24 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  28.24 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1085  hypothetical protein  27.87 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.521139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4646  hypothetical protein  31.4 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2851  hypothetical protein  27.06 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00191961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  29.81 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2559  hypothetical protein  27.06 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0215173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2831  hypothetical protein  27.06 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00686416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  28.45 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1379  hypothetical protein  30.28 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640185  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  30.28 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>