44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1085 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1085  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  256  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.521139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2779  protein of unknown function DUF419  33.61 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273215  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  33.64 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  40.18 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  32.79 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2559  hypothetical protein  36.13 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0215173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  36.13 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2528  hypothetical protein  36.13 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0443587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2605  hypothetical protein  35.29 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.516172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  36.13 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2851  hypothetical protein  35.09 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00191961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2831  hypothetical protein  35.78 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00686416  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  40 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  39.81 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  37.17 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1369  hypothetical protein  33.06 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  31.19 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0096  protein of unknown function DUF419  26.85 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.503641  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  28 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  35.78 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  32.11 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  34.86 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2809  hypothetical protein  34.51 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000596954 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  29.57 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2611  hypothetical protein  35.34 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1268  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000457076 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2801  hypothetical protein  35.34 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.950543  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  34.82 
 
 
123 aa  52  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  29.75 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  29.91 
 
 
135 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  29.46 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  29.46 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  29.46 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  34.62 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0489  hypothetical protein  38.46 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  32.17 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  32.76 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  27.27 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12540  hypothetical protein  27.87 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  28.57 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  31.03 
 
 
114 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  28.04 
 
 
129 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1730  hypothetical protein  25.79 
 
 
168 aa  40  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>