58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0489 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0489  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  221  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1369  hypothetical protein  70.79 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1268  hypothetical protein  63.92 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000457076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1730  hypothetical protein  47.79 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  56.25 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  47.5 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  48.19 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  45 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  42.86 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  38.95 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  41.25 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  47.37 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  40.74 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  42.5 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  33.33 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  36.25 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2831  hypothetical protein  40.74 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00686416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  37.5 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00529  hypothetical protein  36.05 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2851  hypothetical protein  39.51 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00191961  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0660  hypothetical protein  36.05 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0473  hypothetical protein  36.05 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3050  protein of unknown function DUF419  36.05 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0626  hypothetical protein  36.05 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00540  hypothetical protein  36.05 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3067  hypothetical protein  36.05 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0598  hypothetical protein  36.05 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0597  hypothetical protein  37.93 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2559  hypothetical protein  39.51 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0215173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  38.27 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  38.27 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0632  hypothetical protein  36.05 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2611  hypothetical protein  34.88 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207111  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2801  hypothetical protein  34.88 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.950543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2809  hypothetical protein  36.14 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000596954 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0691  hypothetical protein  36.05 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0618  hypothetical protein  36.05 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0675  hypothetical protein  36.05 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0185336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  39.24 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2605  hypothetical protein  37.04 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.516172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  40.26 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  39.24 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2528  hypothetical protein  38.27 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0443587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  36 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  39.47 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  37.14 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0096  protein of unknown function DUF419  31.33 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.503641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1085  hypothetical protein  38.46 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.521139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  36.62 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  34.52 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  35.63 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  51.72 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12530  hypothetical protein  30.95 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1075  hypothetical protein  34.78 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20250  hypothetical protein  30.95 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  38.57 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  34.67 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  33.33 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>