25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2721 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  227  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1379  hypothetical protein  99.11 
 
 		 112 aa  225  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640185  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4064  hypothetical protein  58.04 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  31.86 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  37.86 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1957  hypothetical protein  31.68 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391751  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  29.57 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  28.32 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  27.93 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  28.21 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  25.42 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  25.22 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  29.91 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  29.2 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  28.07 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12530  hypothetical protein  29 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  28.07 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  28.07 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  27.59 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  36.54 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  27.59 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  33.66 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12540  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  28.32 
 
 		 119 aa  40  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>