23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1333 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  245  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  63.56 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06492  hypothetical protein  59.32 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  55.93 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  56.52 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  55.26 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  43.33 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  33.61 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  34.45 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  33.9 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  34.75 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  33.05 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  31.86 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  32.77 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  33.91 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  33.04 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  33.61 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  30.09 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  27.78 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4064  hypothetical protein  30.63 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  28.32 
 
 		 112 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>