31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2177 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  76.27 
 
 		 118 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  75.42 
 
 		 118 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  71.3 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  71.3 
 
 		 119 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  70.43 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  70.43 
 
 		 119 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  67.48 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  66.09 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  66.09 
 
 		 114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  36.84 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  35.83 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  39.82 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  39.81 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  36.67 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  35.24 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  34.78 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  32.74 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  27.78 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  35.14 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06492  hypothetical protein  33.63 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  25 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  28.33 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  27.68 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  22.69 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  32.48 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4064  hypothetical protein  28.07 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  29.06 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  31.93 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  22.69 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>