23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4064 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4064  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  233  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  58.04 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1379  hypothetical protein  57.14 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640185  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  35.34 
 
 		 116 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  34.78 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  35.4 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  35.65 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  33.63 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  33.62 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  35.09 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  29.41 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  28.07 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  31.86 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  31.86 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  31.03 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  31.86 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1957  hypothetical protein  31.31 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391751  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  32.17 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1075  hypothetical protein  28.32 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  27.93 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  30.63 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  34.19 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  29.2 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>