27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1165 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  228  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  43.33 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  39.5 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  35.65 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06492  hypothetical protein  33.9 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  34.21 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  34.23 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  34.23 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  37.07 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  37.61 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  35.78 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  35.09 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  35.51 
 
 
119 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  34.86 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  36.45 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  29.81 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  32.74 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  37.86 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1379  hypothetical protein  38.1 
 
 
112 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640185  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  24.35 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  29.57 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  26.27 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  31.87 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4064  hypothetical protein  32.17 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  30.48 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>