41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3299 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  241  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  98.31 
 
 
118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  75.42 
 
 
121 aa  175  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  67.24 
 
 
119 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  68.1 
 
 
123 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  67.24 
 
 
119 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  66.38 
 
 
119 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  65.52 
 
 
122 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  59.48 
 
 
119 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  58.62 
 
 
114 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  34.23 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  32.77 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  35.04 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  31.48 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  32.23 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  36.28 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  37.14 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  27.88 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  33.9 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  31.03 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  30.83 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06492  hypothetical protein  32.23 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  21.55 
 
 
116 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  26.5 
 
 
116 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  25.45 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  26.05 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  26.72 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  27.87 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  23.93 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  23.93 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  23.93 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  29.31 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312319 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  23.73 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  23.73 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  23.73 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  23.73 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  23.73 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  23.73 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  23.73 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  23.73 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  31.9 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>