27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2864 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  99.16 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  94.12 
 
 		 119 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  87.39 
 
 		 119 aa  220  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  68.91 
 
 		 119 aa  176  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  70.43 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  66.09 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  69.83 
 
 		 118 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  68.1 
 
 		 118 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  65.18 
 
 		 114 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  37.38 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  35.65 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  34.86 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  30.97 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  35.19 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  30.63 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  34.02 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  32.77 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  29.29 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4064  hypothetical protein  31.86 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  22.94 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  28.07 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1379  hypothetical protein  28.07 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640185  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  22.41 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  30.17 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  28.57 
 
 		 119 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>