32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2604 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  244  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  69.75 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  68.91 
 
 		 123 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  68.91 
 
 		 119 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  68.07 
 
 		 119 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  63.25 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  66.09 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  63.16 
 
 		 114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  60.34 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  59.48 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  39.25 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  33.05 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  31.86 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  35.85 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  35.51 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  32.17 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  30.7 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  34.75 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  34.26 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4064  hypothetical protein  33.63 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  24.14 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  28.83 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  29.31 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  26.72 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12530  hypothetical protein  27.42 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  26.27 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  29.2 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1379  hypothetical protein  30.51 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640185  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  25 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  28.7 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  25.47 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>