27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2825 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  243  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  99.16 
 
 		 123 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  94.96 
 
 		 119 aa  233  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  88.24 
 
 		 119 aa  222  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  68.91 
 
 		 119 aa  176  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  66.96 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  70.43 
 
 		 121 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  68.97 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  66.07 
 
 		 114 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  67.24 
 
 		 118 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  37.38 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  36.52 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  35.78 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  36.04 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  30.09 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  30.63 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  34.02 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  33.91 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  28.28 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4064  hypothetical protein  31.86 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  22.94 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  26.67 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  28.45 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  28.07 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1379  hypothetical protein  28.07 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640185  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  28.57 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>