23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1379 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1379  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640185  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  99.11 
 
 		 112 aa  225  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4064  hypothetical protein  57.14 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  32.74 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  38.1 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1957  hypothetical protein  31.68 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391751  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  29.57 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  28.32 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  27.93 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  28.21 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  25.22 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  29.91 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  25.42 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  30.51 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  28.07 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12530  hypothetical protein  29 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  28.07 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  28.07 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  36.54 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12540  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  27.59 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  33.66 
 
 		 137 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>