38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2917 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  94.96 
 
 		 119 aa  233  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  94.12 
 
 		 123 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  88.24 
 
 		 119 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  68.07 
 
 		 119 aa  174  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  71.3 
 
 		 121 aa  164  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  68.97 
 
 		 118 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  66.09 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  67.24 
 
 		 118 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  65.18 
 
 		 114 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  37.61 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  38.26 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  37.84 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  35.51 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  33.05 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  30.09 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  36.27 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  34.45 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  29.63 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4064  hypothetical protein  35.4 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  27.27 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1379  hypothetical protein  28.32 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640185  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2721  hypothetical protein  28.32 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  23.28 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  30.25 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  28.45 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  35.78 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  31.03 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  26.67 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  27.59 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06492  hypothetical protein  29.46 
 
 		 125 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  26.32 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  26.32 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  26.32 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  25.23 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  30.99 
 
 		 117 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  33.33 
 
 		 141 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>