52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3139 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  234  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  82.46 
 
 		 122 aa  202  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  66.07 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  66.07 
 
 		 119 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  65.18 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  65.18 
 
 		 119 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  66.09 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  63.16 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  59.48 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  58.62 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  39.66 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  36.84 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  38.26 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  35.05 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  35.83 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  37.07 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  31 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  36.11 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  36.45 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  33.04 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  26.09 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06492  hypothetical protein  29.75 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  25.93 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  30.16 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  33.04 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  32.76 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  29.57 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  29.73 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20250  hypothetical protein  31.73 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  29.31 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  26.61 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  33.63 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  24.77 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  27.97 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4646  hypothetical protein  29.06 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  28.32 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  29.57 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.834963 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  27.43 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  27.43 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  27.43 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  27.43 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  27.43 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  27.43 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  27.43 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  27.43 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4508  protein YjbR  28.21 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4500  protein YjbR  28.21 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4594  hypothetical protein  28.21 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4595  hypothetical protein  28.21 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1075  hypothetical protein  31.82 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.361914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>