18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06492 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06492  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  262  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  75.42 
 
 
128 aa  191  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  59.32 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  52.5 
 
 
121 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  51.3 
 
 
134 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  33.9 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  30.17 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  33.63 
 
 
121 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  33.06 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  32.23 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  29.66 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  29.75 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  31.53 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  30.36 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  30.95 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  29.46 
 
 
119 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  28.57 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>