42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38710 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  239  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  98.31 
 
 		 118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  76.27 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  68.97 
 
 		 119 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  69.83 
 
 		 123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  68.97 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  68.1 
 
 		 119 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  66.38 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  60.34 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  59.48 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  34.23 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  34.45 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  35.9 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  33.88 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  37.17 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  31.48 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  38.1 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  28.85 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  31.67 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  33.05 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  31.03 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06492  hypothetical protein  33.06 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  22.41 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  27.35 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  26.36 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  26.89 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  27.59 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  27.87 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  23.93 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  23.93 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  23.93 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  29.31 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  23.73 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  23.73 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  23.73 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  23.73 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  23.73 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  23.73 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  23.73 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  23.73 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  24.58 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  26.96 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>