84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4571 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  243  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  243  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  243  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  243  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  243  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  243  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  243  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  100 
 
 		 118 aa  243  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  99.15 
 
 		 118 aa  241  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4508  protein YjbR  93.16 
 
 		 118 aa  226  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4500  protein YjbR  93.16 
 
 		 118 aa  226  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4595  hypothetical protein  92.31 
 
 		 118 aa  225  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4594  hypothetical protein  92.31 
 
 		 118 aa  225  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4646  hypothetical protein  92.31 
 
 		 118 aa  223  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0260  hypothetical protein  83.48 
 
 		 117 aa  207  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  57.39 
 
 		 119 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  57.39 
 
 		 119 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  57.39 
 
 		 119 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4443  hypothetical protein  58.26 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  33.62 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  36.52 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  35.14 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  37.61 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  34.26 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2559  hypothetical protein  32.43 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0215173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  31.03 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2528  hypothetical protein  35.79 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0443587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  30.91 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  30.63 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2831  hypothetical protein  31.82 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00686416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  33.64 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  28.93 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  31.9 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2605  hypothetical protein  30.91 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.516172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  31.62 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2851  hypothetical protein  31.82 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00191961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  37.39 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  33.6 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  31.68 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  26.05 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  31.9 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  30.36 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  41.25 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  32.8 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12530  hypothetical protein  35.35 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1743  hypothetical protein  37.04 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  34.29 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2484  hypothetical protein  38.46 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  32.91 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1730  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  32 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  30.89 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1369  hypothetical protein  30.47 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  30.25 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  42.03 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1268  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000457076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  29.76 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0691  hypothetical protein  29.76 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0675  hypothetical protein  29.76 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0185336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0618  hypothetical protein  29.76 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0632  hypothetical protein  29.76 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12540  hypothetical protein  33.72 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0598  hypothetical protein  27.06 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3050  protein of unknown function DUF419  25.88 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0626  hypothetical protein  25.88 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3067  hypothetical protein  25.88 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0473  hypothetical protein  25.88 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00540  hypothetical protein  25.88 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00529  hypothetical protein  25.88 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0660  hypothetical protein  25.88 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0597  hypothetical protein  25.88 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0377  hypothetical protein  24.32 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1075  hypothetical protein  30.59 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2611  hypothetical protein  31.43 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207111  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  40.74 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2801  hypothetical protein  31.43 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.950543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2809  hypothetical protein  31.43 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000596954 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6087  protein of unknown function DUF419  38.89 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.987598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3350  protein of unknown function DUF419  38.6 
 
 		 222 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0096  protein of unknown function DUF419  26.72 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.503641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  23.73 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  23.73 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  27.43 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>