150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2799 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2799  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 
202 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4489  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  74.75 
 
 
202 aa  316  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.495414  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0636  cyclic nucleotide-binding protein  64.18 
 
 
205 aa  278  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1379  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.49 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3955  cyclic nucleotide-binding protein  29.38 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5404  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.61 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243298  normal  0.0626579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3997  cyclic nucleotide-binding protein  27.91 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1138  cyclic nucleotide-binding protein  25.14 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0914153  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4579  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.49 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249739  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1286  cyclic nucleotide binding regulatory protein  25.7 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0475736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1771  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.33 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.207903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4064  cyclic nucleotide-binding protein  27.61 
 
 
189 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0028  cyclic nucleotide-binding protein  25.44 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7034  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.24 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00763  hypothetical protein  27.66 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2316  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.22 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144016  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5631  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.19 
 
 
197 aa  58.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.344618  normal  0.805191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4303  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.814789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0302  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.19 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1942  cyclic nucleotide binding regulatory protein  22.41 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0673232  normal  0.0303448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2856  cyclic nucleotide-binding protein  27.17 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.5589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2699  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.378618  normal  0.0569969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6187  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.9 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2567  cyclic nucleotide-binding protein  26.74 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3393  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.44 
 
 
192 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2716  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.15 
 
 
189 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0075  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.49 
 
 
236 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.46 
 
 
194 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153014  normal  0.0498746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2756  cyclic nucleotide-binding protein  26.63 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57693  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1388  cyclic nucleotide-binding protein  25.48 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2688  cyclic nucleotide-binding protein  26.63 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.497701  normal  0.0838623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4260  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.52 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  normal  0.714837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2485  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1452  cyclic nucleotide binding regulatory protein  28.4 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177546  normal  0.82146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2178  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6650  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.03 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4604  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.4 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0851  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.59 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4799  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.91 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0776586  hitchhiker  0.00198512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001710  cAMP-binding protein  25.81 
 
 
192 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.689486  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2066  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.56 
 
 
224 aa  52  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0475  cyclic nucleotide-binding protein  23.86 
 
 
189 aa  52  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3733  cyclic nucleotide-binding protein  26.4 
 
 
213 aa  51.6  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.263018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2676  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.86 
 
 
192 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320981  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1692  cyclic nucleotide-binding protein  23.5 
 
 
196 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.08 
 
 
236 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0777  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 
198 aa  51.6  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6135  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.64 
 
 
192 aa  51.2  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3250  cyclic nucleotide-binding protein  28.31 
 
 
190 aa  51.2  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2892  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.32 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1550  protein YieJ  24.18 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3131  cyclic nucleotide-binding protein  26.29 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0259  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.18 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.0138145 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.08 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3217  cyclic nucleotide-binding protein  25.73 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1586  hypothetical protein  23.7 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4453  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.46 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0381566  normal  0.0628964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2895  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.29 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.9 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4057  cyclic nucleotide-binding  20.34 
 
 
196 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2093  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
198 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177732  normal  0.144661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3466  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.03 
 
 
196 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4313  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.42 
 
 
189 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.352776  normal  0.0805957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1090  cyclic nucleotide binding regulatory protein  24.19 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0798  transcription regulator  25 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4326  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.15 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476237  normal  0.0297051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0503  cyclic nucleotide-binding protein  24.86 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.58 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0484  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.2 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.46296  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2568  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.11 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.560798  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1592  cyclic nucleotide-binding protein  22.01 
 
 
192 aa  47  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.619308  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0691  cyclic nucleotide-binding protein  26.63 
 
 
212 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.41 
 
 
219 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4002  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.26 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000843344  normal  0.0193683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0678  cyclic nucleotide binding-regulatory protein  25.43 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2485  cyclic nucleotide binding regulatory protein  21.67 
 
 
188 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00499605  decreased coverage  0.00906372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2686  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.65 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0431  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.02 
 
 
198 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7621  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1116  cyclic nucleotide binding regulatory protein  25 
 
 
196 aa  45.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.221174  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3133  hypothetical protein  26.21 
 
 
237 aa  45.1  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4252  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.19 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.49 
 
 
222 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.36 
 
 
224 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6710  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.43 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3193  cyclic nucleotide-binding protein  22.92 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.71 
 
 
223 aa  45.1  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3164  cyclic nucleotide-binding protein  25.44 
 
 
199 aa  45.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  22.84 
 
 
210 aa  44.7  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  22.84 
 
 
210 aa  44.7  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  22.84 
 
 
210 aa  44.7  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.27 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3085  cyclic nucleotide-binding protein  21.05 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4424  cyclic nucleotide-binding protein  20.39 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  22.84 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  22.84 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.62 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  22.84 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  21.38 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  22.84 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  21.38 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>