281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6318 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1269  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.42 
 
 
953 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1364  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  60.59 
 
 
881 aa  1033    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0578  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.74 
 
 
936 aa  635    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2884  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.05 
 
 
950 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.554581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2047  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
950 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.738586  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4649  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.19 
 
 
954 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.355037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0857  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.42 
 
 
935 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.813693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1190  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.85 
 
 
954 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.977628  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1377  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.95 
 
 
943 aa  640    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2120  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.39 
 
 
949 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2321  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.46 
 
 
963 aa  639    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.676675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2624  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.21 
 
 
963 aa  638    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.844376  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1747  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.42 
 
 
954 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1217  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.51 
 
 
943 aa  643    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.718447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3493  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.21 
 
 
959 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2010  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.39 
 
 
942 aa  636    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2050  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.01 
 
 
950 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.414377  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0998  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.67 
 
 
956 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.162331  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1097  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.85 
 
 
954 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00360454  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0840  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.74 
 
 
951 aa  648    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6318  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  100 
 
 
891 aa  1833    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901944  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2171  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.82 
 
 
958 aa  661    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0853534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1154  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.17 
 
 
945 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3248  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.52 
 
 
959 aa  646    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2013  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.05 
 
 
952 aa  643    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.430973 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1750  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1952  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.77 
 
 
937 aa  634  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0079  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.51 
 
 
948 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1052  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0597  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.74 
 
 
936 aa  634  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1430  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1267  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.78 
 
 
937 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209751  normal  0.0974265 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1924  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0111  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.78 
 
 
940 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1906  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.45 
 
 
958 aa  634  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1484  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0724097 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2556  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  634  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1772  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537135  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1028  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2609  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.11 
 
 
941 aa  634  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1390  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1508  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1000  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0848692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1822  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.45 
 
 
958 aa  635  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.549181 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1498  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0166  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
954 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.673869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1856  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.86 
 
 
963 aa  629  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.61724  normal  0.555418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3979  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.96 
 
 
959 aa  631  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0538563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1144  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.78 
 
 
935 aa  626  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.448629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2914  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.82 
 
 
935 aa  629  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2968  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.33 
 
 
935 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1226  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.6 
 
 
935 aa  624  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.234202 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1188  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.32 
 
 
1001 aa  625  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.489523  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1384  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.33 
 
 
935 aa  623  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.761242  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0140  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.88 
 
 
986 aa  622  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1788  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.12 
 
 
940 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2881  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.33 
 
 
935 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00685  alpha-ketoglutarate decarboxylase  39.48 
 
 
933 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2910  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  39.48 
 
 
933 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0773  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.48 
 
 
933 aa  619  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1236  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.46 
 
 
935 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.824497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2503  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.5 
 
 
943 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858572  normal  0.126982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0738  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.48 
 
 
933 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0892  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.55 
 
 
933 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.349093  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0859  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.55 
 
 
933 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0273322  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3100  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.68 
 
 
935 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00674  hypothetical protein  39.48 
 
 
933 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2812  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.65 
 
 
953 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.198639 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0645  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.48 
 
 
933 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0959  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.52 
 
 
931 aa  619  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.292659  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0769  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.55 
 
 
933 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0830  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.55 
 
 
933 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367116  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1640  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.65 
 
 
953 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337584  normal  0.0829235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1837  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.38 
 
 
940 aa  622  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.343692  normal  0.0435988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0752  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.48 
 
 
933 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0818  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.48 
 
 
933 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.919234  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2930  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.48 
 
 
933 aa  619  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29770  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.75 
 
 
943 aa  618  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2859  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.56 
 
 
945 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256736  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1943  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.76 
 
 
919 aa  616  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0795  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.44 
 
 
933 aa  619  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0976096  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44010  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.91 
 
 
943 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0846  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.35 
 
 
938 aa  618  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1086  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.67 
 
 
945 aa  619  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1614  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.59 
 
 
943 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3492  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2106  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.54 
 
 
953 aa  615  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000654804  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2814  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.07 
 
 
940 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3689  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.69 
 
 
938 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2630  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.03 
 
 
943 aa  609  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2199  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  39.59 
 
 
943 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1721  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.11 
 
 
951 aa  612  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2183  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.73 
 
 
940 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1673  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.94 
 
 
936 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0889  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.91 
 
 
963 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.315483  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01198  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.43 
 
 
942 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2009  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.83 
 
 
943 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01355  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.58 
 
 
941 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2343  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.69 
 
 
940 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0982455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2628  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.89 
 
 
943 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107234  normal  0.0949713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2252  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  39.22 
 
 
935 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.392494  normal  0.744433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>