285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1364 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1772  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.22 
 
 		 954 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537135  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00685  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.17 
 
 		 933 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2910  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  42.17 
 
 		 933 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1097  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.81 
 
 		 954 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00360454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1144  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.09 
 
 		 935 aa  661    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.448629  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1673  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.07 
 
 		 936 aa  667    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2630  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.46 
 
 		 943 aa  641    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1269  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.21 
 
 		 953 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1364  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  100 
 
 		 881 aa  1796    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3493  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.26 
 
 		 959 aa  658    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2219  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.35 
 
 		 934 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2881  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.51 
 
 		 935 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1236  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.44 
 
 		 935 aa  668    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.824497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0818  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.17 
 
 		 933 aa  667    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.919234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0795  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.33 
 
 		 933 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0976096  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1000  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.22 
 
 		 954 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0848692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1052  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.22 
 
 		 954 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0859  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.33 
 
 		 933 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0273322  hitchhiker  0.00122332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0769  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.33 
 
 		 933 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0752  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.17 
 
 		 933 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2009  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.74 
 
 		 943 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2859  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.54 
 
 		 945 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0645  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.17 
 
 		 933 aa  667    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2047  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.09 
 
 		 950 aa  663    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.738586  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2010  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.58 
 
 		 942 aa  668    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2171  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.52 
 
 		 958 aa  669    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0853534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1924  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.22 
 
 		 954 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0111  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.43 
 
 		 940 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1614  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.51 
 
 		 943 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3492  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1377  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.81 
 
 		 943 aa  672    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.850315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2930  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.17 
 
 		 933 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4649  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.67 
 
 		 954 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.355037 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2968  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.51 
 
 		 935 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0857  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.16 
 
 		 935 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.813693  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29770  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.64 
 
 		 943 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2556  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.22 
 
 		 954 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0738  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.17 
 
 		 933 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1484  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.35 
 
 		 954 aa  648    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1747  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.69 
 
 		 954 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2544  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.3 
 
 		 949 aa  645    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.483047  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6318  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  60.48 
 
 		 891 aa  1052    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2321  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.81 
 
 		 963 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.676675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2624  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.9 
 
 		 963 aa  651    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.844376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2812  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.66 
 
 		 953 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.198639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1190  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.69 
 
 		 954 aa  649    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.977628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1640  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.48 
 
 		 953 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337584  normal  0.0829235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1217  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.66 
 
 		 943 aa  662    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.718447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1430  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.47 
 
 		 954 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2914  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.54 
 
 		 935 aa  664    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2050  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.62 
 
 		 950 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.414377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1226  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.86 
 
 		 935 aa  674    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.234202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3100  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.33 
 
 		 935 aa  662    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004112  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.52 
 
 		 941 aa  655    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0773  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.17 
 
 		 933 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1028  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.35 
 
 		 954 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0846  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.06 
 
 		 938 aa  637    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0998  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.09 
 
 		 956 aa  648    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.162331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1799  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.2 
 
 		 940 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1267  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.95 
 
 		 937 aa  667    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209751  normal  0.0974265 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0166  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.22 
 
 		 954 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.673869  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00674  hypothetical protein  42.17 
 
 		 933 aa  667    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0079  alpha-ketoglutarate decarboxylase  43.38 
 
 		 948 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1906  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.8 
 
 		 958 aa  662    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2609  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.21 
 
 		 941 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855464 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1384  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.51 
 
 		 935 aa  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.761242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1390  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.47 
 
 		 954 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1508  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.35 
 
 		 954 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0840  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.86 
 
 		 951 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2884  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.49 
 
 		 950 aa  646    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.554581 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1750  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.22 
 
 		 954 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01875  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.71 
 
 		 939 aa  638    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0131878  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0892  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.33 
 
 		 933 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.349093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0830  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.33 
 
 		 933 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1154  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.44 
 
 		 945 aa  641    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3248  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.8 
 
 		 959 aa  663    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1856  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.44 
 
 		 963 aa  654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.61724  normal  0.555418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1822  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.8 
 
 		 958 aa  662    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.549181 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01355  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.75 
 
 		 941 aa  655    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1498  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.22 
 
 		 954 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3979  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.36 
 
 		 959 aa  654    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0538563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2013  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.5 
 
 		 952 aa  643    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.430973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2199  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  40.62 
 
 		 943 aa  635  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1188  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.4 
 
 		 1001 aa  634  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.489523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2106  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.27 
 
 		 953 aa  633  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000654804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2800  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.18 
 
 		 945 aa  634  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307679  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1086  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.94 
 
 		 945 aa  635  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0889  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.41 
 
 		 963 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.315483  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1721  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.19 
 
 		 951 aa  632  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3512  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.95 
 
 		 943 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2120  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.37 
 
 		 949 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01198  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.16 
 
 		 942 aa  627  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2503  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.54 
 
 		 943 aa  626  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858572  normal  0.126982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3760  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.84 
 
 		 943 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0361197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0959  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.82 
 
 		 931 aa  628  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.292659  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0803  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.31 
 
 		 963 aa  628  1e-178  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0102  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.34 
 
 		 961 aa  622  1e-177  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1665  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.61 
 
 		 943 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44010  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.16 
 
 		 943 aa  625  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1710  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.02 
 
 		 939 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3689  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.28 
 
 		 938 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>