149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1542 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1542  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.199996 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  79.52 
 
 
154 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  79.52 
 
 
154 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  79.27 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  63.86 
 
 
154 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3891  putative endoribonuclease L-PSP  59.76 
 
 
152 aa  94.4  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130303  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  40.96 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  34.27 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  36.23 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  45.12 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 
157 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  46.05 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  44.05 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  33.73 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  43.37 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  42.11 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  40.24 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  38.55 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  44.58 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  41.89 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  36.14 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  34.91 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  40.24 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  38.55 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  40.24 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  42.68 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  46.48 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  46.48 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  46.48 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  42.68 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  41.1 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  29.68 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  42.47 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  38.27 
 
 
167 aa  54.3  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  41.89 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 
151 aa  53.9  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  31.33 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  34.94 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 
155 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  37.35 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  40.24 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  38.55 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  41.18 
 
 
407 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  43.06 
 
 
161 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 
152 aa  50.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  35.37 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  38.36 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6524  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.372376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  47.62 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  41.43 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  30.57 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  36.9 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  37.33 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  37.35 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  37.35 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
153 aa  48.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  37.76 
 
 
153 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  39.76 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  37.11 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  38.36 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  43.48 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5670  endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 
162 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  39.19 
 
 
162 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  38.75 
 
 
158 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  42.17 
 
 
153 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  33.82 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  35.37 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  35.37 
 
 
160 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  35.29 
 
 
185 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  35.29 
 
 
185 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  36.76 
 
 
409 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>