291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3112 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3112  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  358  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  63.72 
 
 		 328 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  63.72 
 
 		 304 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  63.72 
 
 		 328 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  74.44 
 
 		 305 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  74.44 
 
 		 305 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 304 aa  131  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  68.89 
 
 		 321 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2220  LysR family transcriptional regulator  70 
 
 		 317 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  74.44 
 
 		 320 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  68.89 
 
 		 328 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1646  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  73.33 
 
 		 315 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0678  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  73.33 
 
 		 315 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1028  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  73.33 
 
 		 331 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2333  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  73.33 
 
 		 315 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2953  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  73.33 
 
 		 329 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0041469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  73.33 
 
 		 331 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  73.33 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 304 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 318 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 316 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  52.03 
 
 		 311 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2215  transcriptional regulator, LysR family  56.6 
 
 		 314 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2675  transcriptional regulator, LysR family  56.6 
 
 		 314 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3010  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4657  LysR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 316 aa  74.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.933923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  39.56 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  39.56 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  39.56 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  39.56 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  39.56 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  39.56 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  39.56 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 305 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2531  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1388  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 295 aa  64.3  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 301 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1922  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1491  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 308 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  37.89 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  39.08 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2679  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  39.76 
 
 		 300 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  39.76 
 
 		 300 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  40.79 
 
 		 303 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  40.79 
 
 		 303 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 297 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  38.71 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2500  transcriptional regulator, LysR family  35.48 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0184  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 323 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  45.31 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05372  transcription regulator protein  43.68 
 
 		 335 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 294 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  43.75 
 
 		 296 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 303 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0242  LysR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 312 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 295 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4453  transcriptional regulator, LysR family  40.23 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.47384 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4587  transcriptional regulator, LysR family  40.23 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.781824  normal  0.831534 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 298 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 326 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 305 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 305 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 326 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 305 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 326 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 309 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 296 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6203  LysR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 298 aa  52  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4455  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 295 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246938 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 296 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  36.36 
 
 		 297 aa  51.6  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1308  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 302 aa  51.6  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1832  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 300 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 298 aa  52  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 295 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 296 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 295 aa  51.2  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4123  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 302 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 302 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3831  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 302 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5767  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 275 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4425  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 302 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>