More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5319 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5319  ABC transporter related  100 
 
 		 285 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3935  ABC transporter related  98.19 
 
 		 285 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2533  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  97.1 
 
 		 285 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3585  ABC transporter related  97.54 
 
 		 285 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5100  ABC transporter related  95.26 
 
 		 286 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143244  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0097  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  74.72 
 
 		 302 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  52.29 
 
 		 660 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  49.62 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 256 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  46.01 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  46.39 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  47.35 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  46.67 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  46.97 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  49.24 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.86 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  44.78 
 
 		 258 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  44.87 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  46.18 
 
 		 255 aa  225  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  44.66 
 
 		 255 aa  225  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  46.01 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  46.74 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  44.78 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  48.34 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  44.03 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  45.33 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  43.89 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  49.24 
 
 		 273 aa  222  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  46.95 
 
 		 253 aa  222  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  47.15 
 
 		 255 aa  221  9e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  42.18 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  44.12 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.28 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  43.66 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  50 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  43.66 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  43.66 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  45.8 
 
 		 283 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  47.15 
 
 		 612 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  44.03 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  42.91 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  47.55 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  41.57 
 
 		 265 aa  218  6e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  45.8 
 
 		 293 aa  218  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  43.56 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  43.66 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  43.28 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  44.91 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  43.66 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  45.83 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  44.91 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  44.87 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  41.82 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  42.11 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  41.83 
 
 		 262 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  44.94 
 
 		 261 aa  215  8e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.73 
 
 		 254 aa  215  8e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  44.11 
 
 		 256 aa  215  8e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  45.42 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.44 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  44.78 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  45.42 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  43.94 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  45.42 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  42.21 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  45.25 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  41.67 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  42.37 
 
 		 253 aa  212  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  42.48 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  43.82 
 
 		 288 aa  211  9e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  47.94 
 
 		 252 aa  211  9e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  42.54 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  44.98 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  42.86 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  42.54 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.49 
 
 		 261 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  47.13 
 
 		 271 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  44.4 
 
 		 260 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  42.75 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3028  ABC transporter related  46.99 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0925872  normal  0.887889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  45.9 
 
 		 257 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  43.13 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  42.54 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  42.11 
 
 		 257 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  42.54 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  42.32 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 257 aa  209  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  43.12 
 
 		 261 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  46.38 
 
 		 261 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  45.62 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  44.57 
 
 		 256 aa  209  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  44.87 
 
 		 280 aa  208  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  44.24 
 
 		 257 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  41.22 
 
 		 253 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>