More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2079 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0780  ApbE family protein  95.79 
 
 
404 aa  720    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.725216  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0494  ApbE family protein  98.22 
 
 
394 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1982  ApbE family protein  98.22 
 
 
394 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.63389  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0565  ApbE family protein  95.79 
 
 
404 aa  720    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.53612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2079  ApbE family protein  100 
 
 
394 aa  779    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1630  ApbE family protein  95.79 
 
 
404 aa  720    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0677  ApbE family protein  95.79 
 
 
404 aa  720    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  78.68 
 
 
365 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  72.16 
 
 
329 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  71.58 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  40.7 
 
 
321 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  40.84 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  40.84 
 
 
325 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3291  ApbE family lipoprotein  58.38 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238915  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  38.52 
 
 
327 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  38.79 
 
 
327 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  54.74 
 
 
315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  55.5 
 
 
320 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  55.43 
 
 
305 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  58.33 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.1 
 
 
350 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.1 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.1 
 
 
350 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.1 
 
 
350 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.84 
 
 
350 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  44.51 
 
 
370 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  43.59 
 
 
350 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  40.96 
 
 
337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  42.6 
 
 
341 aa  146  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  44.24 
 
 
338 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  47.59 
 
 
337 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  33.25 
 
 
340 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  43.48 
 
 
338 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  44.51 
 
 
341 aa  143  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  45.62 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  40 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  40 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  42.31 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  29.81 
 
 
349 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  40 
 
 
374 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  44.51 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  34.53 
 
 
331 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  46.2 
 
 
342 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  39.23 
 
 
338 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  39.11 
 
 
347 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  42.24 
 
 
343 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.12 
 
 
353 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  41.32 
 
 
348 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  41.32 
 
 
348 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  41.32 
 
 
348 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  43.37 
 
 
332 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  45.88 
 
 
337 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  41.32 
 
 
348 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  42.86 
 
 
338 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  46.43 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  42.94 
 
 
355 aa  137  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  49.71 
 
 
800 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  39.16 
 
 
347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  39.41 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  45.03 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  35.58 
 
 
351 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  35.58 
 
 
351 aa  132  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  35.58 
 
 
351 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  35.58 
 
 
351 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  35.58 
 
 
351 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  35.58 
 
 
351 aa  132  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  35.58 
 
 
351 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  35.58 
 
 
351 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  35.58 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  44.12 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  37.06 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  43.67 
 
 
337 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  45.4 
 
 
338 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  37.5 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  43.9 
 
 
345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.88 
 
 
334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  35.29 
 
 
379 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  43.03 
 
 
343 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  29.1 
 
 
326 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.57 
 
 
348 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  37.43 
 
 
343 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  44.44 
 
 
338 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.7 
 
 
348 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.84 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  38.82 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.82 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  38.82 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0427  ApbE family lipoprotein  32.66 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127952  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  35.88 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  36.61 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  43.48 
 
 
332 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  43.21 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.52 
 
 
351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  43.79 
 
 
332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  39.15 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.73 
 
 
349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.35 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  22.92 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  38.36 
 
 
337 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  43.29 
 
 
362 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>