More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1112 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1112  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  100 
 
 
240 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2879  amino acid ABC transporter periplasmic protein  99.17 
 
 
240 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2727  solute-binding family 1 protein  98.75 
 
 
240 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  65.44 
 
 
289 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  60 
 
 
297 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  60.52 
 
 
297 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  56.77 
 
 
294 aa  281  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  61.64 
 
 
296 aa  272  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1655  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  60.43 
 
 
326 aa  262  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.92194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  54.63 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  55.81 
 
 
295 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  53.21 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  44.3 
 
 
297 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1560  extracellular solute-binding protein family 3  46.01 
 
 
302 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000128549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  44.05 
 
 
297 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.49 
 
 
297 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  44.05 
 
 
297 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  43.61 
 
 
297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  43.61 
 
 
297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  43.78 
 
 
297 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  43.61 
 
 
297 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  43.4 
 
 
302 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  43.4 
 
 
302 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  43.87 
 
 
297 aa  188  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  42.99 
 
 
298 aa  187  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  41.78 
 
 
305 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  44.34 
 
 
299 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  41.78 
 
 
305 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  43.32 
 
 
297 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  41.78 
 
 
305 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  41.38 
 
 
301 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  42.2 
 
 
302 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  42.92 
 
 
302 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  42.92 
 
 
302 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  42.36 
 
 
297 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  41.98 
 
 
298 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  42.36 
 
 
298 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  42.92 
 
 
302 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  42.36 
 
 
328 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  42.92 
 
 
302 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  42.92 
 
 
302 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  42.92 
 
 
302 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  42.36 
 
 
328 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  43.19 
 
 
319 aa  185  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  42.92 
 
 
302 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  42.92 
 
 
302 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  42.92 
 
 
298 aa  185  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  43.66 
 
 
330 aa  185  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  42.06 
 
 
298 aa  184  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  42.4 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  43.19 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  43.19 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  43.19 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  43.19 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  43.19 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  43.4 
 
 
359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  42.11 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  43.19 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  42.45 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  41.67 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  42.45 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44 
 
 
306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  42.67 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  43.11 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  43.56 
 
 
330 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  42.65 
 
 
299 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  42.36 
 
 
301 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0222  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  42.45 
 
 
299 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  42.72 
 
 
302 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  41.85 
 
 
313 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6965  extracellular solute-binding protein family 3  41.71 
 
 
312 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  42.25 
 
 
302 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  40.09 
 
 
291 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  42.72 
 
 
334 aa  176  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  41.92 
 
 
301 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  41.59 
 
 
333 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  40.72 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.26 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4477  extracellular solute-binding protein family 3  42.45 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  43.56 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  43.56 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  40.79 
 
 
301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  41.12 
 
 
302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  40.72 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  41.78 
 
 
298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  41.78 
 
 
298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  43.11 
 
 
306 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  41.78 
 
 
298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  41.31 
 
 
298 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  40.09 
 
 
299 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  42.92 
 
 
301 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5289  extracellular solute-binding protein  41.59 
 
 
300 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
304 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  39.57 
 
 
298 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5110  extracellular solute-binding protein family 3  40.09 
 
 
295 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2540  extracellular solute-binding protein  43.33 
 
 
310 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2255  extracellular solute-binding protein  41.04 
 
 
307 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>