More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0022 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0022  ribose transport system permease protein RbsC, internal deletion  100 
 
 		 357 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1511  carbohydrate ABC transporter permease  99.44 
 
 		 361 aa  662    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1424  carbohydrate ABC transporter permease  99.72 
 
 		 361 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5168  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  52.48 
 
 		 349 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6461  inner-membrane translocator  52.9 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0887311  normal  0.300113 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5974  inner-membrane translocator  53.23 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43600  AraH family inner-membrane translocator  53.58 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.822717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2760  ribose transport permease protein, putative  55.56 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.792455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2993  inner-membrane translocator  55.21 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2368  ABC sugar (ribose) transporter, inner membrane subunit  49.84 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.163977  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1028  inner-membrane translocator  49.84 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4171  inner-membrane translocator  50.31 
 
 		 329 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2875  inner-membrane translocator  51.25 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966602  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2994  ribose ABC transporter, permease protein, putative  50.16 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3307  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1178.1  ribose transport system permease protein RbsC, internal deletion  95.5 
 
 		 200 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.744822  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  33.93 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 308 aa  133  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2722  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.54 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.54 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.3 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.3 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  32.91 
 
 		 311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  32.91 
 
 		 311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 		 835 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.16 
 
 		 350 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  32.99 
 
 		 306 aa  126  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.28 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.31 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.39 
 
 		 346 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.54 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  30.26 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.23 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.31 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2874  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  31.61 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2982  monosaccharide-transporting ATPase  34.26 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.018273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30.23 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  32.08 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  33.14 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  29.64 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  30.34 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.42 
 
 		 345 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  30.93 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  34.03 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  32.46 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  32.46 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2030  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.38 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  31.02 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  32.37 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  31.88 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.65 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2907  Monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 323 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0357751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  30.12 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  28.31 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 342 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 342 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  27.19 
 
 		 314 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 342 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.98 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3057  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.5 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2721  inner-membrane translocator  31.61 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  30.79 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>