More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1241 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3325  C4-dicarboxylate transport protein  100 
 
 		 205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.983039  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1241  C4-dicarboxylate transport protein 3  100 
 
 		 205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2461  C4-dicarboxylate transporter DctA  98.48 
 
 		 440 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3460  C4-dicarboxylate transporter DctA  98.48 
 
 		 440 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3458  C4-dicarboxylate transporter DctA  98.48 
 
 		 440 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0379  C4-dicarboxylate transporter DctA  98.48 
 
 		 440 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3423  C4-dicarboxylate transporter DctA  98.48 
 
 		 440 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1203  C4-dicarboxylate transporter DctA  96.46 
 
 		 440 aa  360  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0541  C4-dicarboxylate transporter DctA  85.35 
 
 		 440 aa  346  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0567  C4-dicarboxylate transporter DctA  85.35 
 
 		 440 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245555  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3732  C4-dicarboxylate transporter DctA  84.34 
 
 		 440 aa  344  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0613  C4-dicarboxylate transporter DctA  83.84 
 
 		 439 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0163  C4-dicarboxylate transporter DctA  83.84 
 
 		 439 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0646  C4-dicarboxylate transporter DctA  83.84 
 
 		 439 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2740  C4-dicarboxylate transporter DctA  83.84 
 
 		 452 aa  338  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0765011  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3388  C4-dicarboxylate transporter DctA  80.3 
 
 		 441 aa  324  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2596  C4-dicarboxylate transporter DctA  81.31 
 
 		 442 aa  323  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0568  C4-dicarboxylate transporter DctA  79.29 
 
 		 440 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3948  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.5 
 
 		 442 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3473  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.5 
 
 		 446 aa  228  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3146  C4-dicarboxylate transporter DctA  58 
 
 		 446 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3444  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.28 
 
 		 467 aa  224  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3279  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.79 
 
 		 463 aa  222  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0237  C4-dicarboxylate transporter DctA  55 
 
 		 447 aa  220  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1101  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.5 
 
 		 425 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3275  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.5 
 
 		 446 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.292333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1420  C4-dicarboxylate transporter DctA  56 
 
 		 443 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4878  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.33 
 
 		 437 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3085  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.55 
 
 		 440 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5335  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.33 
 
 		 443 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09460  C4-dicarboxylate transport protein  50.51 
 
 		 433 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.81039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  50.51 
 
 		 440 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  50.51 
 
 		 440 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  50.51 
 
 		 440 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4368  C4-dicarboxylate transporter DctA  51 
 
 		 441 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4433  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.08 
 
 		 438 aa  201  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0194  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.37 
 
 		 444 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01460  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.37 
 
 		 449 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.881945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  51.02 
 
 		 439 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0554  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.01 
 
 		 435 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 		 454 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  50.51 
 
 		 439 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0796  C4-dicarboxylate transporter DctA  58 
 
 		 437 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.86356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  48.98 
 
 		 437 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2255  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.3 
 
 		 436 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.16569  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3483  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.3 
 
 		 436 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.225944  normal  0.530275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1886  C4-dicarboxylate transporter DctA  51.3 
 
 		 437 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0307  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.11 
 
 		 444 aa  194  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.7 
 
 		 449 aa  193  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1729  C4-dicarboxylate transporter DctA  50.78 
 
 		 436 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3012  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.56 
 
 		 436 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.723105  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  53.85 
 
 		 428 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.18 
 
 		 429 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.72 
 
 		 431 aa  191  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3956  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.12 
 
 		 438 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8666  sodium:dicarboxylate symporter  50.78 
 
 		 466 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.82 
 
 		 429 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  52.31 
 
 		 429 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4324  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.61 
 
 		 438 aa  188  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.269388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  48.21 
 
 		 453 aa  187  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0462  sodium:dicarboxylate symporter  45.37 
 
 		 443 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.67 
 
 		 450 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  46.63 
 
 		 460 aa  184  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1872  C4-dicarboxylate transporter  48.7 
 
 		 430 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2324  sodium:dicarboxylate symporter  46.7 
 
 		 465 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365188  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  49.5 
 
 		 442 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2601  sodium:dicarboxylate symporter  46.7 
 
 		 465 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0835858  normal  0.133431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.23 
 
 		 442 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.6 
 
 		 444 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.63 
 
 		 430 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2129  sodium:dicarboxylate symporter  44.62 
 
 		 457 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213541  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.19 
 
 		 429 aa  177  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.19 
 
 		 429 aa  177  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.13 
 
 		 465 aa  177  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.23 
 
 		 429 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.23 
 
 		 430 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.23 
 
 		 429 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.23 
 
 		 430 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.19 
 
 		 429 aa  177  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.15 
 
 		 452 aa  177  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.15 
 
 		 448 aa  177  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.67 
 
 		 430 aa  177  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.9 
 
 		 447 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.72 
 
 		 430 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  46.63 
 
 		 447 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.21 
 
 		 429 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  45.88 
 
 		 453 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.15 
 
 		 436 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.74 
 
 		 440 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.67 
 
 		 430 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  43.15 
 
 		 428 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.15 
 
 		 428 aa  175  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.15 
 
 		 428 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.21 
 
 		 429 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2279  sodium:dicarboxylate symporter  44.62 
 
 		 462 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316015  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.15 
 
 		 428 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.15 
 
 		 428 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.15 
 
 		 428 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.64 
 
 		 436 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.15 
 
 		 428 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>