More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09460 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_09460  C4-dicarboxylate transport protein  100 
 
 		 433 aa  852    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.81039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  67.97 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  69.93 
 
 		 431 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2729  sodium:dicarboxylate symporter  66.11 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.75 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.02 
 
 		 430 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.42 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.02 
 
 		 444 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.31 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.29 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.18 
 
 		 444 aa  544  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.78 
 
 		 430 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.29 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  63.28 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.78 
 
 		 430 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.01 
 
 		 428 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.01 
 
 		 428 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.07 
 
 		 429 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.01 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.01 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.01 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  66.01 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0225  C4-dicarboxylate transporter DctA  65.04 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0518  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.39 
 
 		 426 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51947  normal  0.633866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.91 
 
 		 447 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4197  C4-dicarboxylate transporter DctA  64.41 
 
 		 426 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  57.24 
 
 		 453 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1364  sodium:dicarboxylate symporter  58.57 
 
 		 438 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  56.18 
 
 		 439 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.81 
 
 		 444 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  59.9 
 
 		 447 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  55.27 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  59.9 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  58.94 
 
 		 447 aa  484  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.06 
 
 		 454 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  58.44 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.95 
 
 		 443 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  60.15 
 
 		 425 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  58.97 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  57.7 
 
 		 437 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  58.48 
 
 		 447 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1457  sodium:dicarboxylate symporter  60.83 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4108  sodium:dicarboxylate symporter  58.74 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  60.25 
 
 		 453 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  58.46 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  58.66 
 
 		 447 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.66 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2279  sodium:dicarboxylate symporter  57.35 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316015  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2129  sodium:dicarboxylate symporter  57.11 
 
 		 457 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213541  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  57.7 
 
 		 440 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  57.7 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  58.56 
 
 		 450 aa  471  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  57.7 
 
 		 440 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.46 
 
 		 444 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  55.74 
 
 		 460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3060  sodium:dicarboxylate symporter  58.19 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.97 
 
 		 450 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  57.95 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.97 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  58.31 
 
 		 450 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2601  sodium:dicarboxylate symporter  55.92 
 
 		 465 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0835858  normal  0.133431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2324  sodium:dicarboxylate symporter  55.92 
 
 		 465 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365188  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  60.2 
 
 		 455 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  55.18 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  55.18 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.18 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.18 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.18 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.18 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.4 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  55.18 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1456  sodium:dicarboxylate symporter  56 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0183  sodium:dicarboxylate symporter  57.95 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2297  sodium:dicarboxylate symporter  59.47 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.372192  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.18 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.92 
 
 		 447 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.66 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31210  C4-dicarboxylate transport protein  57.49 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.39 
 
 		 451 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.19 
 
 		 452 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.31 
 
 		 439 aa  458  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.57 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2841  sodium:dicarboxylate symporter  56.66 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.76 
 
 		 442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.85 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.57 
 
 		 440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.61 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.1 
 
 		 440 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.99 
 
 		 440 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.88 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.48 
 
 		 447 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.19 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.74 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.46 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.44 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.19 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.21 
 
 		 448 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  54.08 
 
 		 454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.23 
 
 		 442 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02396  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.19 
 
 		 434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>