More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0232 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  84.83 
 
 		 253 aa  330  9e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  60.32 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  63.79 
 
 		 351 aa  227  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  60.54 
 
 		 329 aa  223  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  62.5 
 
 		 415 aa  207  7e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  60.95 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  67.12 
 
 		 177 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  65.07 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  60.39 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  61.69 
 
 		 179 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  64.38 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  64.08 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  65.49 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  65.49 
 
 		 168 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  53.94 
 
 		 401 aa  192  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  56.11 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  56.9 
 
 		 195 aa  190  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  55.83 
 
 		 182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  59.15 
 
 		 396 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  59.74 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  50.8 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  60.96 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  57.05 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  59.18 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  61.27 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  61.27 
 
 		 204 aa  185  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  59.15 
 
 		 356 aa  185  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  53.55 
 
 		 243 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  63.38 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  62.32 
 
 		 149 aa  181  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 201 aa  181  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  55.56 
 
 		 238 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  55.56 
 
 		 238 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  55.56 
 
 		 238 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  56.34 
 
 		 207 aa  178  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  62.69 
 
 		 175 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  54.23 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  53.85 
 
 		 175 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  53.52 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  51.75 
 
 		 154 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  54.36 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 		 193 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  50.7 
 
 		 357 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  54.93 
 
 		 173 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 194 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  51.75 
 
 		 154 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  50.35 
 
 		 164 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  52.11 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  52.63 
 
 		 137 aa  154  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  52.11 
 
 		 173 aa  154  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 		 173 aa  154  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  48.63 
 
 		 178 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 194 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 194 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  52.11 
 
 		 173 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  51.41 
 
 		 176 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  51.75 
 
 		 145 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  51.05 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  48.97 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  48.25 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  47.89 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  51.41 
 
 		 174 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  47.55 
 
 		 177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  48.61 
 
 		 171 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  51.41 
 
 		 176 aa  151  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  47.55 
 
 		 178 aa  151  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  51.41 
 
 		 173 aa  151  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  50 
 
 		 154 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  47.55 
 
 		 179 aa  150  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  53.15 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  53.52 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  48.95 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0065  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 145 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  49.65 
 
 		 151 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  49.65 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  47.55 
 
 		 176 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  51.41 
 
 		 178 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  48.25 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  47.4 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  48.63 
 
 		 154 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  47.68 
 
 		 174 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  48.95 
 
 		 181 aa  148  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  50.35 
 
 		 173 aa  148  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  52.99 
 
 		 134 aa  147  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  48.97 
 
 		 174 aa  147  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  52.99 
 
 		 134 aa  147  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  48.3 
 
 		 175 aa  147  9e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  50.35 
 
 		 153 aa  147  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  43.09 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  49.65 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  47.26 
 
 		 156 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 156 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>