49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B3803 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B3803  lysM domain protein  100 
 
 
159 aa  319  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  hitchhiker  1.81276e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1542  lysM domain protein  97.48 
 
 
159 aa  283  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1396  lysM domain-containing protein  96.86 
 
 
159 aa  280  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000873032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1507  lysm domain-containing protein  96.86 
 
 
159 aa  280  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000123436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1612  lysM domain-containing protein  89.31 
 
 
159 aa  263  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000378837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1648  lysM domain protein  89.31 
 
 
159 aa  263  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000383151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1368  peptidoglycan-binding protein  88.68 
 
 
159 aa  261  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1409  peptidoglycan-binding LysM  87.42 
 
 
159 aa  258  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000791474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1369  peptidoglycan-binding protein  90.57 
 
 
162 aa  249  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.6403400000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1581  lysM domain protein  90.57 
 
 
159 aa  249  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05729e-36 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1210  peptidoglycan-binding LysM  61.11 
 
 
160 aa  174  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000146268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2191  Peptidoglycan-binding LysM  34.57 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0438  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.23 
 
 
180 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  39.06 
 
 
471 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0569  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.06 
 
 
471 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  41.94 
 
 
849 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  38.98 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.74 
 
 
334 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3975  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.28 
 
 
430 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1716  peptidoglycan-binding LysM  39.22 
 
 
597 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.925679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  37.1 
 
 
474 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2542  peptidoglycan-binding LysM  29.75 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0261672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0894  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.82 
 
 
472 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2095  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.62 
 
 
335 aa  44.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.9 
 
 
270 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  47.92 
 
 
451 aa  43.9  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
289 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  43.75 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.76 
 
 
576 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.42 
 
 
435 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.7 
 
 
554 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4688  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.85 
 
 
477 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802168  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 
516 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  41.51 
 
 
509 aa  42  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  42.31 
 
 
571 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  35.53 
 
 
216 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  45.65 
 
 
419 aa  41.6  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.6 
 
 
440 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  33.78 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  40.32 
 
 
485 aa  41.2  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36 
 
 
447 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  35.53 
 
 
650 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40 
 
 
840 aa  41.2  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  40.98 
 
 
265 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.7 
 
 
631 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  46.94 
 
 
583 aa  40.8  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.7 
 
 
593 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  40.98 
 
 
265 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.07 
 
 
637 aa  40.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>