81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_04040 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04077  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000245375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04040  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000184018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  99.07 
 
 		 215 aa  220  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  99.07 
 
 		 215 aa  220  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  99.07 
 
 		 215 aa  220  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  99.07 
 
 		 215 aa  221  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  79.61 
 
 		 212 aa  176  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  78.64 
 
 		 212 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5720  hypothetical protein  83.33 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0717251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 227 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 241 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 239 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  33.02 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 216 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 235 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 248 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 226 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 263 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 210 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 233 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  26.53 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2513  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 214 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 216 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 231 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 222 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 202 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  26.74 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 225 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 231 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 232 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 224 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 224 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 232 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 232 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 232 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 232 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 212 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  24.21 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  24.49 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  22.83 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 212 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 192 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 212 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0520  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 228 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  20.83 
 
 		 241 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>