287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6040 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  100 
 
 		 483 aa  986    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  29.77 
 
 		 478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  36.17 
 
 		 226 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  35.46 
 
 		 226 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  30.04 
 
 		 267 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  29.91 
 
 		 255 aa  90.5  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  31.67 
 
 		 229 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  28.84 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.82 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.04 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  29.24 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  24.44 
 
 		 243 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  28.27 
 
 		 242 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  27.66 
 
 		 241 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  33.33 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00248  phosphoprotein phosphatase  31.58 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  28.39 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  27.19 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  27.85 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.82 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  32 
 
 		 276 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  28.35 
 
 		 176 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  25.57 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  27.97 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  29.11 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  29.05 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  30.73 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  28.51 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  28.51 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  29.06 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  30.81 
 
 		 556 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  26.89 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  28.51 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  29 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  25.88 
 
 		 256 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  27.46 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  29.52 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  24.45 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  28.96 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 573 aa  71.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  33.54 
 
 		 705 aa  70.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  26.07 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  28.94 
 
 		 507 aa  70.5  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  30.3 
 
 		 556 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  32.47 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  29.59 
 
 		 582 aa  70.1  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  28.23 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  30.38 
 
 		 564 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  25.41 
 
 		 234 aa  69.7  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  36 
 
 		 268 aa  69.7  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  30.58 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  27.42 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  31.44 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  26.03 
 
 		 256 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  31.47 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.73 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  27.1 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1295  protein serine/threonine phosphatase  27.8 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  27 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  25.21 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  25.41 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  28.35 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  30.15 
 
 		 555 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.21 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.82 
 
 		 517 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  31.31 
 
 		 559 aa  66.6  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1360  protein phosphatase  27.39 
 
 		 240 aa  66.6  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  29.11 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  32.16 
 
 		 566 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  29.8 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  37.63 
 
 		 237 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.15 
 
 		 516 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  26.86 
 
 		 247 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  34.74 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  30.1 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  26.76 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  28.69 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  27.75 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  24.23 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  24.89 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  26.36 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  29.49 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  25.69 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.69 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.69 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  25.2 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  29.24 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  29.13 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  26.15 
 
 		 514 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  37.5 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  27.27 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  25.2 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  28.87 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  22.84 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  29.61 
 
 		 562 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  31.28 
 
 		 556 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  30.3 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  25.86 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  26.64 
 
 		 239 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  25.74 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>