More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0044 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  85.74 
 
 
478 aa  729    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
482 aa  951    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  55.24 
 
 
463 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  49.52 
 
 
472 aa  335  7.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  45.48 
 
 
441 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  48.89 
 
 
421 aa  330  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  45.16 
 
 
474 aa  329  8e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  40.96 
 
 
505 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  49.88 
 
 
474 aa  326  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  48.9 
 
 
477 aa  320  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  45.36 
 
 
514 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  53.35 
 
 
478 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  44.49 
 
 
467 aa  310  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  44.97 
 
 
469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.98 
 
 
491 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  44.98 
 
 
491 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.98 
 
 
491 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  42.73 
 
 
519 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.78 
 
 
516 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  44.55 
 
 
466 aa  299  8e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  46.06 
 
 
479 aa  298  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  43.02 
 
 
426 aa  295  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  49.23 
 
 
462 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.49 
 
 
517 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  42.09 
 
 
449 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  41.57 
 
 
540 aa  289  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  37.09 
 
 
500 aa  286  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  45.37 
 
 
463 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  56.12 
 
 
507 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.59 
 
 
241 aa  259  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  52.7 
 
 
241 aa  259  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  34.62 
 
 
564 aa  243  5e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  49.8 
 
 
265 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  51.95 
 
 
253 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  52.4 
 
 
364 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  50.39 
 
 
259 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  32.9 
 
 
554 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  50.21 
 
 
239 aa  223  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  50.84 
 
 
239 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.64 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  49.2 
 
 
571 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  56.06 
 
 
687 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  50.63 
 
 
247 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  51.07 
 
 
511 aa  210  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  44.6 
 
 
558 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  43.77 
 
 
567 aa  207  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  33.42 
 
 
394 aa  196  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  34.03 
 
 
395 aa  189  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  33.67 
 
 
452 aa  188  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  45.41 
 
 
519 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  48.32 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  45.87 
 
 
255 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  33.81 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  45.87 
 
 
239 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  44.96 
 
 
355 aa  176  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  41.99 
 
 
404 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.04 
 
 
237 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  46.49 
 
 
267 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  36.78 
 
 
239 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  40.16 
 
 
361 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  39.84 
 
 
323 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  41.48 
 
 
236 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  38.11 
 
 
325 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  37.76 
 
 
259 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  37.76 
 
 
259 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  39.33 
 
 
236 aa  145  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  35.47 
 
 
236 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.01 
 
 
611 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  38.68 
 
 
256 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  35.95 
 
 
238 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  40.17 
 
 
256 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.5 
 
 
261 aa  143  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  38.03 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 
256 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  38.13 
 
 
597 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  41.49 
 
 
422 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  39.32 
 
 
241 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.25 
 
 
238 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
386 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  37.55 
 
 
256 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  31.8 
 
 
241 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  37.6 
 
 
258 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
267 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  38.33 
 
 
240 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  34.94 
 
 
276 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  38.86 
 
 
381 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.87 
 
 
247 aa  137  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.14 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  35.25 
 
 
319 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  38.52 
 
 
261 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  36.07 
 
 
284 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  35.8 
 
 
267 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  36.71 
 
 
242 aa  133  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.96 
 
 
470 aa  133  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  32.5 
 
 
245 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  36.29 
 
 
242 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  37.4 
 
 
253 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  32.24 
 
 
245 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  40.17 
 
 
293 aa  131  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  32.95 
 
 
257 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>