More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3832 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  76.56 
 
 
256 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  74.22 
 
 
256 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  61.18 
 
 
259 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  51.57 
 
 
256 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  45 
 
 
242 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  44.58 
 
 
242 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.58 
 
 
243 aa  201  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  43.55 
 
 
255 aa  188  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  45.96 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.15 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  45.53 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  42.5 
 
 
264 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  44.16 
 
 
262 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  43.83 
 
 
242 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  42.74 
 
 
270 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  39.33 
 
 
267 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  44.26 
 
 
242 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.26 
 
 
242 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  42.98 
 
 
276 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  43.48 
 
 
395 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  37.25 
 
 
245 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  42.42 
 
 
425 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  45.16 
 
 
248 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  40.16 
 
 
394 aa  150  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  37.05 
 
 
419 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.91 
 
 
237 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  43.37 
 
 
252 aa  148  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  40.42 
 
 
426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  39.66 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  36.57 
 
 
417 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  35.15 
 
 
239 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  39.92 
 
 
469 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  35.51 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  37.34 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  36.95 
 
 
267 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  39.67 
 
 
238 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  33.89 
 
 
239 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.33 
 
 
238 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  37.87 
 
 
236 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  39.83 
 
 
477 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.16 
 
 
251 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  42.8 
 
 
234 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  39.57 
 
 
467 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  40.09 
 
 
463 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  38.89 
 
 
478 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  38.78 
 
 
320 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.46 
 
 
482 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  39 
 
 
422 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  43.1 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  41.38 
 
 
236 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  37.34 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  37.77 
 
 
239 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  35.86 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  39.57 
 
 
441 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.7 
 
 
247 aa  138  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  35.74 
 
 
325 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  39.3 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  36.48 
 
 
241 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  40.61 
 
 
296 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  36.22 
 
 
276 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  40.73 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  36.02 
 
 
323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  37.8 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  36.13 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.65 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  39.47 
 
 
472 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  37.55 
 
 
452 aa  135  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  40.89 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  38.63 
 
 
421 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  37.35 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  38.63 
 
 
449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  40.43 
 
 
507 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  37.35 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  37.35 
 
 
256 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  40.77 
 
 
463 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  35.46 
 
 
257 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  32.91 
 
 
241 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  40.96 
 
 
348 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  37.02 
 
 
478 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  39.32 
 
 
264 aa  131  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  39.66 
 
 
505 aa  131  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  37.77 
 
 
416 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
519 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  38.96 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  38.2 
 
 
404 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.02 
 
 
247 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00248  phosphoprotein phosphatase  41.59 
 
 
216 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  36.26 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  36.71 
 
 
474 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  39.3 
 
 
540 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  36.78 
 
 
305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  36.21 
 
 
415 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  37.22 
 
 
364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  38.24 
 
 
466 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.59 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  38.28 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 
597 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  34.29 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>