More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2458 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 		 258 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  52.44 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  52.61 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  41.04 
 
 		 395 aa  162  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  41.06 
 
 		 452 aa  157  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.81 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  41.86 
 
 		 425 aa  151  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  41.3 
 
 		 472 aa  148  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  41.74 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.94 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  36.78 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  40.24 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  35.68 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  40.85 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  43.32 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  41.32 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.75 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  42.86 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  41.91 
 
 		 519 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  39.84 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  39.43 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  39.42 
 
 		 236 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.7 
 
 		 237 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  38.34 
 
 		 463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  38.82 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  38.59 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  38.93 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.55 
 
 		 242 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  41.35 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  37.45 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  37.4 
 
 		 505 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  40.39 
 
 		 270 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  37.8 
 
 		 478 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  41.1 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  39.53 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  40.52 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  39.58 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  39.67 
 
 		 422 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  38.34 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  36.64 
 
 		 267 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  38.15 
 
 		 421 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  39.66 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  35 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.99 
 
 		 482 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  33.74 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  41.35 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  36.95 
 
 		 477 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  34.98 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  38.63 
 
 		 463 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  37.4 
 
 		 323 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  37.24 
 
 		 478 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  42.62 
 
 		 258 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  36.86 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  29.76 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  32.1 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  36.05 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  37.89 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  33.47 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  40.38 
 
 		 514 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  38.35 
 
 		 567 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  33.2 
 
 		 250 aa  121  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  33.74 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  37.3 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  34.55 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  37.29 
 
 		 469 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  35.56 
 
 		 554 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  35.37 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  35.77 
 
 		 426 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  31.85 
 
 		 500 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.58 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  35.17 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  37.86 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.25 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  35.94 
 
 		 558 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  34.69 
 
 		 507 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  34.02 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  36.78 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  34.2 
 
 		 313 aa  118  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  37.72 
 
 		 467 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  36.8 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.02 
 
 		 516 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  45.74 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  36.6 
 
 		 479 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.98 
 
 		 438 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.02 
 
 		 517 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  31.32 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  36.48 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  38.06 
 
 		 325 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  36.61 
 
 		 466 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  36 
 
 		 571 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  34.01 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  32.13 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  36.17 
 
 		 491 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.17 
 
 		 491 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.17 
 
 		 491 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  32.13 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1997  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  35.15 
 
 		 474 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  36.97 
 
 		 348 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>