More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0105 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 		 242 aa  481  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  67.92 
 
 		 242 aa  333  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  69.07 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  70.42 
 
 		 242 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  68.64 
 
 		 242 aa  322  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  50.64 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  45.87 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  45.87 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1112  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  42.48 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.89 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  45.96 
 
 		 256 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  43.39 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  45.96 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  44.92 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.5 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  44.26 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  37.87 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  39.11 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  38.91 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  35.47 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  36 
 
 		 417 aa  148  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  40.82 
 
 		 319 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  39.08 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  37.77 
 
 		 239 aa  144  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  36.84 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  36.17 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  40.95 
 
 		 421 aa  141  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  42.67 
 
 		 519 aa  141  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  39.19 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  39.74 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.8 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  37.61 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  40.6 
 
 		 463 aa  134  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  38.26 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  33.76 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  39.15 
 
 		 426 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.76 
 
 		 287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  37.39 
 
 		 395 aa  132  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  39.24 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  36.56 
 
 		 478 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  38.98 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.97 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  28.63 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.1 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  41.06 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  38.33 
 
 		 467 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  36.96 
 
 		 452 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.19 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  35.65 
 
 		 394 aa  129  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.27 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  34.41 
 
 		 264 aa  128  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.6 
 
 		 258 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  39.39 
 
 		 469 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  37.66 
 
 		 441 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  31.98 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  37.87 
 
 		 236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  36.32 
 
 		 422 aa  125  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  31.64 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  36.6 
 
 		 472 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  36.05 
 
 		 478 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  36.49 
 
 		 474 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 		 449 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  33.61 
 
 		 267 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  33.98 
 
 		 548 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  35.14 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  37.77 
 
 		 463 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  36.67 
 
 		 540 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  37.97 
 
 		 466 aa  122  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.62 
 
 		 482 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  34.26 
 
 		 597 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  37.18 
 
 		 474 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  30.67 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  31.93 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.67 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  38.79 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 419 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  37.97 
 
 		 500 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00248  phosphoprotein phosphatase  42.38 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  38.27 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  34.54 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  37.17 
 
 		 491 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.17 
 
 		 491 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.17 
 
 		 491 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  34.26 
 
 		 435 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  36.55 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  37.3 
 
 		 280 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  34.32 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  33.91 
 
 		 425 aa  119  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  35.93 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  36.89 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  33.33 
 
 		 505 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  36.48 
 
 		 514 aa  118  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  32.77 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  36.6 
 
 		 266 aa  118  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.17 
 
 		 516 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>