More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3950 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
261 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  72.03 
 
 
261 aa  391  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  63.22 
 
 
261 aa  345  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  55.98 
 
 
270 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  56.11 
 
 
271 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  55.73 
 
 
271 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  57.72 
 
 
269 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  56.38 
 
 
268 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  49.8 
 
 
266 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  45.83 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  44.26 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  41.06 
 
 
267 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  42.26 
 
 
252 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  42.21 
 
 
296 aa  185  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  43.9 
 
 
293 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 
249 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  40.5 
 
 
254 aa  175  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  42.28 
 
 
256 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  43.15 
 
 
256 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  38.17 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.08 
 
 
237 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  42.74 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  42.74 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  35.95 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  36.4 
 
 
257 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  36.21 
 
 
240 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  37.96 
 
 
252 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.66 
 
 
247 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5885  protein serine/threonine phosphatase  38.71 
 
 
259 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  36.29 
 
 
250 aa  158  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  41.56 
 
 
425 aa  158  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  37.5 
 
 
250 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  37.5 
 
 
250 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  36.89 
 
 
246 aa  156  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  37.87 
 
 
238 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  36.29 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  37.34 
 
 
244 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  35.43 
 
 
417 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  39.68 
 
 
395 aa  155  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  35.48 
 
 
250 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  35.89 
 
 
250 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  35.89 
 
 
250 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  35.89 
 
 
250 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  35.89 
 
 
250 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  35.89 
 
 
250 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  35.48 
 
 
250 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  39.75 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  40.64 
 
 
258 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  40.51 
 
 
236 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 
253 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  36.1 
 
 
236 aa  151  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  35.59 
 
 
243 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  37.5 
 
 
255 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2391  protein serine/threonine phosphatase  39.1 
 
 
422 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  40.66 
 
 
381 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  37.35 
 
 
245 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  36.88 
 
 
313 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.02 
 
 
238 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  38.11 
 
 
449 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0318  serine/threonine phosphatase, putative  38.78 
 
 
245 aa  148  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  35.51 
 
 
250 aa  148  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  39.09 
 
 
472 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  34.04 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  38.43 
 
 
452 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  35.86 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  39.41 
 
 
416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  35.86 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
419 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  37.04 
 
 
386 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0530  serine/threonine protein phosphatase, putative  36.1 
 
 
249 aa  145  5e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.467374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  38.96 
 
 
305 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  35.89 
 
 
548 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  37.94 
 
 
394 aa  145  7.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2765  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.07 
 
 
419 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  31.85 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  39.67 
 
 
505 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 
415 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  33.61 
 
 
236 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  36.93 
 
 
245 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  40.8 
 
 
477 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  40.56 
 
 
292 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  36.7 
 
 
264 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  34.14 
 
 
241 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 
320 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.5 
 
 
482 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  36.1 
 
 
246 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  36.86 
 
 
474 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  40.52 
 
 
478 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
478 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 
280 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  36.8 
 
 
597 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  38.4 
 
 
449 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  36.33 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.11 
 
 
611 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2540  protein serine/threonine phosphatases  39.22 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3671  putative serine/threonine phosphatase  36.29 
 
 
246 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  34.17 
 
 
239 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  36.59 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  34.85 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>