More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10380 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  100 
 
 
255 aa  504  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  55.51 
 
 
540 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  55.1 
 
 
426 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  55.12 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  54.29 
 
 
441 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  56.5 
 
 
253 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  53.23 
 
 
265 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  51.02 
 
 
449 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  52.61 
 
 
463 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  56.07 
 
 
467 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  52.65 
 
 
474 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  50.97 
 
 
466 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  50.61 
 
 
472 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  53.47 
 
 
469 aa  208  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  51.84 
 
 
477 aa  205  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  50.61 
 
 
421 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  50.41 
 
 
259 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  49.8 
 
 
505 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  48.39 
 
 
463 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  49.59 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  48.57 
 
 
500 aa  195  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  46.67 
 
 
519 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  48.36 
 
 
507 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  50.85 
 
 
514 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  51.28 
 
 
516 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  49.57 
 
 
491 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  49.57 
 
 
491 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  50.43 
 
 
517 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  49.57 
 
 
491 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  46.28 
 
 
478 aa  185  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.87 
 
 
482 aa  185  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  47.48 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  47.01 
 
 
567 aa  181  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.62 
 
 
241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  44.22 
 
 
241 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  47.26 
 
 
474 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  45.76 
 
 
478 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  45.02 
 
 
558 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  49.6 
 
 
479 aa  175  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  46.67 
 
 
462 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  47.28 
 
 
511 aa  172  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  45.02 
 
 
571 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.08 
 
 
239 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  44.49 
 
 
239 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  48.68 
 
 
687 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  44.3 
 
 
519 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.28 
 
 
438 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  47.43 
 
 
369 aa  162  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  44.63 
 
 
404 aa  158  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  39.3 
 
 
254 aa  154  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  38.21 
 
 
554 aa  154  9e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  41.87 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  39.76 
 
 
395 aa  152  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  47.37 
 
 
355 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.5 
 
 
261 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  38.37 
 
 
258 aa  149  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  37.9 
 
 
425 aa  149  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  37.55 
 
 
564 aa  149  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.22 
 
 
237 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  37.65 
 
 
261 aa  145  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.98 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  42.8 
 
 
416 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  40.24 
 
 
394 aa  144  9e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  40.74 
 
 
452 aa  144  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.8 
 
 
238 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  37.55 
 
 
238 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  35.29 
 
 
250 aa  142  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  41.6 
 
 
361 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  37.08 
 
 
249 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  38.37 
 
 
236 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.08 
 
 
271 aa  142  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
320 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  39.51 
 
 
319 aa  141  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  37.94 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  40.24 
 
 
253 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  34.68 
 
 
271 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  42.15 
 
 
386 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  32.81 
 
 
241 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  38.02 
 
 
261 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_002620  TC0530  serine/threonine protein phosphatase, putative  35.32 
 
 
249 aa  137  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.467374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  43.28 
 
 
236 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  37.74 
 
 
270 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
257 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  45.19 
 
 
267 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  34.8 
 
 
236 aa  135  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  41.74 
 
 
422 aa  135  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  35.71 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  36.75 
 
 
239 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  41.88 
 
 
234 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0318  serine/threonine phosphatase, putative  35.1 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  34 
 
 
245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  41.3 
 
 
293 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  33.2 
 
 
245 aa  132  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  39.51 
 
 
234 aa  131  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  35.02 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  37.45 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  35.98 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  35.02 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  32.39 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  35.34 
 
 
597 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>