More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0081 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
519 aa  1014    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  42.75 
 
 
505 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  47.64 
 
 
491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  47.64 
 
 
491 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  47.64 
 
 
491 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  66.53 
 
 
472 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  44.88 
 
 
514 aa  324  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  44.81 
 
 
477 aa  318  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.07 
 
 
482 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  43.67 
 
 
478 aa  303  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  43.17 
 
 
441 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  63.11 
 
 
474 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  41.71 
 
 
463 aa  283  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  59.91 
 
 
478 aa  282  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  62.67 
 
 
517 aa  282  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  61.78 
 
 
516 aa  279  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  41.91 
 
 
426 aa  276  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  43.27 
 
 
469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  41.26 
 
 
474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  59.24 
 
 
421 aa  272  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  39.12 
 
 
500 aa  263  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  40.24 
 
 
466 aa  259  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  42.19 
 
 
462 aa  256  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  38.5 
 
 
449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  55.9 
 
 
467 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  53.56 
 
 
540 aa  253  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  54.25 
 
 
463 aa  239  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  57.26 
 
 
479 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  51.46 
 
 
241 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  53.16 
 
 
507 aa  233  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  53.12 
 
 
364 aa  233  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  51.46 
 
 
241 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  53.16 
 
 
265 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  32.16 
 
 
564 aa  225  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  51.91 
 
 
253 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.07 
 
 
438 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  54.08 
 
 
511 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  50.62 
 
 
247 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  55.56 
 
 
687 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  43.25 
 
 
567 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  32.01 
 
 
554 aa  200  6e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  40.94 
 
 
571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  35.24 
 
 
519 aa  194  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  43.25 
 
 
558 aa  193  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  49.17 
 
 
239 aa  193  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  46.67 
 
 
255 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  48.33 
 
 
239 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  44.58 
 
 
259 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  48.95 
 
 
239 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  35.83 
 
 
422 aa  179  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  44.83 
 
 
395 aa  176  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  46.15 
 
 
425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  46.09 
 
 
404 aa  173  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  35.84 
 
 
416 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  43.21 
 
 
394 aa  168  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  44.83 
 
 
369 aa  163  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  42.48 
 
 
319 aa  163  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  48.66 
 
 
267 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  43.59 
 
 
355 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  43.1 
 
 
452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  39.52 
 
 
258 aa  154  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.82 
 
 
247 aa  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  43.24 
 
 
256 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  41.13 
 
 
242 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.44 
 
 
237 aa  150  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  42.86 
 
 
236 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  38.62 
 
 
238 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  43.8 
 
 
361 aa  150  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  35.44 
 
 
236 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  40.69 
 
 
242 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.34 
 
 
287 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  35.51 
 
 
241 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  39.53 
 
 
276 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  39.24 
 
 
538 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.45 
 
 
280 aa  143  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  39.15 
 
 
242 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.67 
 
 
242 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  37.4 
 
 
597 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  41.95 
 
 
305 aa  141  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.02 
 
 
238 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  40.96 
 
 
253 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  40 
 
 
256 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.27 
 
 
611 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  35.22 
 
 
239 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  32.35 
 
 
245 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  36.1 
 
 
249 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  33.61 
 
 
245 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.56 
 
 
261 aa  136  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  37.82 
 
 
252 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  34.85 
 
 
250 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  37.92 
 
 
270 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  36 
 
 
254 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  34.58 
 
 
250 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2540  protein serine/threonine phosphatases  43.04 
 
 
245 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 
256 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  36.51 
 
 
236 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.3 
 
 
258 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  36.59 
 
 
267 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.73 
 
 
271 aa  134  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>