More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1112 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1112  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  100 
 
 		 217 aa  453  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.48 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  36.73 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  36.28 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  35.4 
 
 		 242 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  36.28 
 
 		 242 aa  147  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  34.08 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.63 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  31.74 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  31.86 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  31.17 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  31.17 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  29.6 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  31.25 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  31.58 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  31.14 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  30.97 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  31.42 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  29.87 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 270 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.22 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00248  phosphoprotein phosphatase  31.53 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3671  putative serine/threonine phosphatase  29.24 
 
 		 246 aa  95.1  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.75 
 
 		 258 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  28.93 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  29.6 
 
 		 276 aa  88.6  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  27.42 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  30.34 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  28.69 
 
 		 267 aa  85.5  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.26 
 
 		 237 aa  85.1  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.24 
 
 		 238 aa  84.7  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  27.08 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  29.22 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  30.24 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6845  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 		 548 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3315  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.09 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  28.27 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.99 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  27.8 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  29.61 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  28.51 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  27.8 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.54 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.44 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  26.17 
 
 		 574 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  27.94 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  33.51 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 		 597 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  28.06 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  26.27 
 
 		 323 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  26.91 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  26.91 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0544  protein serine/threonine phosphatases  29.3 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  28.8 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.51 
 
 		 611 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  28.4 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.57 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  26.05 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  25.21 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3143  protein serine/threonine phosphatases  27.84 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000847096  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  27.02 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  25.39 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  25.88 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  28.06 
 
 		 449 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.31 
 
 		 287 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  27.43 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  27.53 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  34.27 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  30.04 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  27.31 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  27.04 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  29.69 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  26.38 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  26.16 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 		 596 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1295  protein serine/threonine phosphatase  27.59 
 
 		 240 aa  72  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1360  protein phosphatase  27.59 
 
 		 240 aa  72  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  29.22 
 
 		 571 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  26.64 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  27.16 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  26.64 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  25.78 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  27 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.46 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  25.32 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  29.26 
 
 		 591 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  27.32 
 
 		 576 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  25.99 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  24.58 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.23 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  26.5 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  25.85 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  27.84 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  23.75 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.77 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  29.27 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>